【用户讲座】越长越佳：多倍体植物案例

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功能介绍 Oxford Nanopore Technologies

2019-16-30

演讲题目：越长越佳——多倍体植物案例

演讲嘉宾： 杨俊博士 中国科学院上海辰山植物科学研究中心

副研究员，洪堡学者，中国科学院青年创新促进会成员。2016年初正式加入上海辰山植物园，并开始组建旋花科进化研究组。近年先后参加了科技部国际合作专项以及自然科学基金青年项目的研究工作，建立和优化了高效甘薯遗传转化体系用于研究块根形成机理，完成了六倍体甘薯基因组测序，建立了旋花科基因组研究全球协作网络和番薯属基因组数据库。

演讲背景：

我国甘薯产量巨大，但是复杂的遗传背景一直以来是制约甘薯研究的瓶颈，甘薯起源问题悬而未决。甘薯基因组共有约4.4亿个碱基对，单组大小在700M到800M之间。虽然近年来高通量测序技术日新月异，但解析多倍体基因组仍然面临着巨大的障碍。

演讲要点：

• 介绍六倍体甘薯极其起源

• 六倍体基因组的单倍型分析和准确度评估

• 使用纳米孔测序的单倍型分析准确度评估

• 纳米孔长读长帮助建立更好的甘薯基因组

• 甘薯中的转基因组插入序列T-DNA

• 纳米孔测序技术在识别T-DNA复杂结构中的优势

• 直接测序RNA的展望

   

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