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Nanopore全国巡演第一站圆满落幕
2019-35-26
最美不过人间四月天，最忙不过全国巡演季。趁着阳光正好，微风不燥，4月，百迈客全面开启了Nanopore全长转录组与甲基化全国巡演交流会。
近年来，转录组测序已经成为研究基因表达及调控网络的基础手段。然而，二代测序技术无法精确保留转录本结构信息；三代测序技术之Pacbio系列需要结合二代数据做定量分析。如何兼顾高通量、长读长、准确定量多方面需求，是新一代测序技术需要解决的问题。针对这些问题，百迈客本次巡演主要介绍了新一代Nanopore全长转录组和甲基化测序原理、技术优势、应用方向和高分文章前沿等等，引起了科研工作者强烈的反响，非常认同Nanopore测序技术未来发展趋势。 Nanopore测序原理和技术优势 2012年Oxford Nanopore Technologies（ONT）公司推出基于纳米孔技术的商业测序仪，可以将电信号转化为碱基序列。一时引起广泛关注，利用ONT平台发表的文章如雨后春笋。Nanopore测序技术不仅可以获得全长的mRNA分子序列信息，同时完成结构分析和准确定量，还能直接读取DNA或RNA上的多种甲基化信息，让科研效率更上一层楼！
实测数据分享
为了让Nanopore全长转录组技术更快、更好运用到科研项目，经不断努力，截至目前，百迈客已经建立超过上百种物种类型的文库，拥有大量的项目经验！百迈客最近一批数据新鲜出炉，快来围观~ 1. 测序质量 在经过滤短片段和低质量数据后，其平均长度在1300bp左右，平均质量值Q8以上，全长率在70%左右，比对率在80%以上。
数据特征统计表 2. Nanopore定量分析 Nanopore转录组可不依赖二代测序数据进行定量分析，但只有测序的数据量达到饱和，定量才会准确。从我们目前的实测数据看，随着测序数据量的增加，不同片段长度的转录本在不到6G就均已达到饱和。
不同片段长度转录本饱和度图 3. 全基因组甲基化 DNA甲基化是表观遗传的经典修饰方式，主要包括 C5-甲基胞嘧啶（5mC）、N6-甲基腺嘌呤（6mA）等。目前常用重亚硫酸盐法（WGBS）检测5mC，其精确度高，但化学处理会导致DNA分子的片段化、测序深度高、无法鉴定更多修饰类型。我们比较WGBS和Nanopore技术检测甲基化的效果，发现使用Nanopore技术可以检测到更多的甲基化位点和甲基化类型，而且与WGBS结果一致性超过94%。 甲基化位点数量统计表
巡演现场
第一站，我们来到了东部、南部和北京，为期一个月的巡演中，我们走过15座城市，完成28场交流会。通过每一场对Nanopore全长转录组和甲基化测序技术深度的交流讨论，我们彼此走地更近了。您需要什么？我们能为您提供什么？未来我们还需要做什么？感谢各位长期以来的支持与信任，我们会继续深耕细作，期待我们的下一次相遇。 巡演首秀，爆照啦！下图有没有你的身影？ 北京巡演现场
成都巡演现场
杭州巡演现场
武汉巡演现场
郑州巡演现场
汕头巡演现场
没有上图的小伙伴不用担心哦，5月我们还会持续巡演，涉及到Nanopore全长转录组、甲基化、代谢组在科学研究中的应用、多组学联合分析等内容，多款主题随你挑~ 一个月呼啸而过，北京、深圳、厦门、汕头、成都、武汉、合肥、南京、杭州、上海、郑州……下一站是哪里？ 还未巡演的区域 或者想单独开展课题组讲座的同学和老师 欢迎扫描下方二维码留言
我们将根据您的申请需求， 第一时间为您安排专业的课题组讲座！
截至目前，百迈客已拥有3台ONT最高通量测序仪PromethION，建立超过上百种物种类型的文库，并已搭建较为成熟的Nanopore全长转录组建库测序和信息分析流程。百迈客是中国大陆唯一也是首家ONT官方认证——RNA测序资质，致力于将最前沿测序技术提供给科研工作者。
ONT官方认证证书
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