详细说明

1D^2测序试剂盒

暂无价格
产品编号 SQK-LSK308
产品说明

推荐以下用户使用该试剂盒:

  • 需要获得比常规1D化学法准确度更高的单读长

1D^2 连接测序试剂盒方法灵活,能在80分钟内构建用于纳米孔测序的1D^2 文库。1D^2 通过有效利用特殊的测序接头来促进测序中互补链能够紧随模板链之后进入纳米孔。

1D^2 测序试剂盒详情:

特征性质
制备时间80分钟
起始样本要求1000ng的双链DNA
是否需要PCR
片段化可选
读长等于片段长度
产生读长类型1D^2
典型通量*•••
相关实验方案

1D^2 测序试剂盒(1D^2 Sequencing Kit)

扩增子测序*

序列捕获

Blue Pippin长读长选择

混样建库测序可选产品

无扩增条形码试剂盒 (Native Barcoding Kit)

PCR条码试剂盒 (PCR Barcoding Kit)

芯片清洗试剂盒 (Flow Cell Wash Kit)

包装规格6个反应
稳定性

运输温度:2–8°C

长期储存温度:-20°C

兼容性

测序芯片:

FLO-MIN107

 

当与1D^2 分析工具联合使用时,这种测序方法可产生比1D测序准确度更高的读长(模型准确度为97%),尽管1D测序和1D^2 测序获得的序列一致性的准确度大致相当。此外,由于在1D^2测序运行中对两条链均进行了测序,这意味着在1D^2测序中观察到的分子数要少于1D测序,因此1D测序具有更高的覆盖度。

 

 

 

 

该试剂盒需要1-1.5μg的起始样本量,无需要使用PCR。

 

如有必要,可以使用Covaris g-TUBE将基因组DNA打断。但是,如果您的实验需要长读长,则不建议进行片段化。使用NEBNext End Repair/dA-tailing模块进行DNA末端修复和dA尾添加后,把连接测序试剂盒(Ligation Sequencing Kit)中提供的测序接头连接到DNA上,由此引入能使DNA链进入纳米孔所需的组成部分。另外,1D^2 接头能使纳米孔在测序模板链后立即捕获互补链。一次只针对双链体的一条链进行测序,产生1D^2 读长。

进一步考虑:

1D^2 分析工具仍在开发当中,使用1D^2 软件在识别大量长度一致的片段 (如:扩增子)时,会偶尔出现错配。该情况将会在后续的版本中得到改进。因此,建议用户单使用1D测序来运行数据,并将其原始数据文件保存好,以便在分析工具更新版本推出后可对其继续进行分析。尽管各类方案和分析工具仍在开发当中,用户仍可以通过使用PCR条形码试剂盒(PCR Barcoding Kit)或无扩增条形码测序试剂盒(Native Barcoding Kit)来实现混样建库测序。

Oxford Nanopore technologies视该产品的使用寿命为自客户收到产品之日起的3个月。


盒内物品

1D^2 测序试剂盒含有足够量的试剂, 足以构建6个测序文库。


BAM:条码测序接头(Barcode adapter mix)ELB:洗脱缓冲液(Elution buffer)
ABB:接头-磁珠结合(Adapter bead binding)PRM:聚合酶链式反应引物(PCR primer)
LMD: λDNA (Lambda DNA)PCA: 聚合酶链式反应接头(PCR adapter)
DCS:脱氧核糖核酸标准试样(DNA CS)1D^2:1D^2接头(1D^2 adapter)
RBF:测序运行缓冲液(Running buffer with fuel mix)(DNA CS)

 

同时提供测序文库上样颗粒扩展包(Library Loading Beads Expansion Pack)


LLB:测序文库上样颗粒(Library loading beads)


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